请问FPGA控制驱动AD9945该如何设置SDATA？

SHP、SHD、DATACLK都可以由FPGA来产生。SPI是串口通讯协议，用来配置AD9945的寄存器的。具体您可以参考数据手册P9 Figure4.
您写的CCD的驱动程序是用来直接控制CCD的（而不是AD9945），使CCD能够正确的产生模拟信号送进AD9945中被采样和AD转换。