ARM9 AT91SAM9260如何用串口烧裸机程序呢？

使用的软件根据你使用的操作系统不同而不同。
大体上来说，流程都差不多，
1) 首先 ARM 上面 boot strap mode 需要设定好，一般来说，都要设定成 boot from internal ROM，如果你的 ARM 没有这个选项，那麽下面的都不用看了。
2) 找到跟你使用的操作系统相关的 boot loader。
3) ARM 开机以串口连结上 PC。
4) 选择下载 boot loader
5) 看你的 internal boot ROM 的选项，有些会下载完毕後，直接跳到 boot loader 重新开机。
6) 接下来就是 boot loader 开机。跟着指令，下载你的操作系统烧录到 Flash 里面。
7) ARM 关机，然後把boot strap mode设定回 Flash 开机。
当然，有很多 ARM 的 boot strap mode 的设定不同，有些是 boot from USB，boot from SD 等等，不一而足，但是跟你要从串口烧机无关，就不多说了。

你用atmel的SAM-BA V2.12试试？我用这给3X8E烧写过程序，看到里面有9260、9261的选项。