新建工程的时候没有AT89S51这种芯片怎么办呢？

应该是你安装的是keil的arm，而不是keil的c51，你要单独安装keil的c51，如果你需要两个版本共同存在，不起冲突，你可能还需要看下网上有关介绍，否则运行起来可能会有问题。