STM32的JTAG接口可以做普通IO使用吗？

可以的，要在IO初始化的时候禁用JTAG加入下面两句即可
RCC_APB2PeriphClockCmd(RCC_APB2Periph_AFIOENABLE);
GPIO_PinRemapConfig(GPIO_Remap_SWJ_JTAGDisableENABLE);